导致鸡曲霉菌病发生的真菌主要是烟曲霉和黄曲霉，饲喂品质低劣或发霉的饲料，如发霉的玉米、麸皮、鱼粉或混合饲料，或使用被污染发霉的垫草，是暴发本病的直接原因。
黄曲霉毒素(AFT)是一类化学结构类似的化合物，均为二氢呋喃香豆素的衍生物。黄曲霉毒素是主要由黄曲霉 (aspergillus flavus)寄生曲霉 (a.parasiticus)产生的次生代谢产物，在湿热地区食品和饲料中出现黄曲霉毒素的机率最高。
它们存在于土壤、动植物、各种坚果中，特别是容易污染花生、玉米、稻米、大豆、小麦等粮油产品，是霉菌毒素中毒性最大、对人类健康危害极为突出的一类霉菌毒素。
烟曲霉毒素是由串珠镰刀菌（Fusariummoniliforme）产生，通常在霉变的玉米中发现。烟曲霉毒素发现较晚，最早于1988年报告。最常见的烟曲霉毒素是烟曲霉毒素B，而常见的的烟曲霉毒素B有三种，分别是FB1、FB2和FB3。
饲养密度大，鸡舍通风不良，舍内外温差大，温度和湿度又有利于霉菌的繁殖，易诱发本病。夏秋多雨潮湿，饲料及原料容易发霉变质。进入冬季，使用这些饲料和原料，很容易导致鸡曲霉菌病的发生。
冠宇仪器生产的霉菌毒素检测仪能够快速定量检测粮食、饲料、谷物、食用油、调味品等食品中黄曲霉毒素、T2毒素、呕吐毒素、赭曲霉毒素、伏马毒素、玉米赤霉烯酮，真菌毒素残留定量分析仪适用于粮油监测中心、粮油饲料生产加工、食品加工贸易、畜禽养殖户自查、工商质监部门用于市场快速筛查等
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